学科建设办公室在校党委和校行政领导下，总体负责学校的学科建设工作，其主要职责如下：

1、负责制订学校学科建设发展战略、规划及制订相关管理规章制度；

2、负责组织上海市高水平地方高校（学科）建设项目的申报、管理工作；

3、负责组织上海市高峰高原学科建设项目的申报、管理工作；

4、负责组织开展一级学科评估工作；

5、开展学科建设的分析和研究工作，为学校制定战略发展规划提供决策咨询；

6、协调学校学科建设的日常工作；

7、完成上级部门和校领导交办的其他工作。